הקשר בין השיר "סיבת הסיבות" לפרשת ואתחנן נעוץ במסר של אמונה והכנעה לרצון ה'.
פרשת ואתחנן נפתחת בתפילתו הנואשת של משה רבנו לה', שיאפשר לו להיכנס לארץ ישראל, אך תפילתו נדחית על ידי הקב"ה. משה מקבל את גזירת ה' בהכנעה מתוך הכרה בגדולתו.
השיר "סיבת הסיבות" מבטא מסר של אמונה טוטאלית בכך שה' הוא "סיבת הסיבות" וכל מה שקורה, לטוב ולרע, הוא חלק מתוכניתו ושהכל לטובה.